Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSKSQ9UJT2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms