Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUF60Q9UHX1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms