Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms