Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms