Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX20Q9UHI6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX20Q9UHI6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX20Q9UHI6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX20Q9UHI6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX20Q9UHI6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX20Q9UHI6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX20Q9UHI6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms