Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLKQ9UBT6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms