Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TFIP11Q9UBB9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFIP11Q9UBB9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms