Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHD7Q9P2D1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms