Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCHIP1Q9P0W5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms