Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD3Q9NYL9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
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