Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLCO1C1Q9NYB5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLCO1C1Q9NYB5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms