Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TOR4AQ9NXH8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR4AQ9NXH8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms