Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC17Q9NVM6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms