Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms