Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC4Q9NTJ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms