Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4BQ9NT99 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms