Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOMER2Q9NSB8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOMER2Q9NSB8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOMER2Q9NSB8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOMER2Q9NSB8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOMER2Q9NSB8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms