Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms