Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms