Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELP3Q9H9T3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELP3Q9H9T3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms