Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRDE2Q9H7Z3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRDE2Q9H7Z3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms