Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSUN3Q9H649 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSUN3Q9H649 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms