Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM49AQ9H0Q0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM49AQ9H0Q0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms