Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms