Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms