Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms