Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM42Q9BTD8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms