Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK4

FEM1A, Protein fem-1 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEM1AQ9BSK4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FEM1AQ9BSK4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms