Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT8

CBWD1, COBW domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD1Q9BRT8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD1Q9BRT8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD1Q9BRT8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD1Q9BRT8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD1Q9BRT8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD1Q9BRT8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBWD1Q9BRT8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBWD1Q9BRT8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms