Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GORASP1Q9BQQ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GORASP1Q9BQQ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms