Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TREX2Q9BQ50 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TREX2Q9BQ50 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms