Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGMNQ99538 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms