Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD1Q99460 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMD1Q99460 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms