Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SIN3AQ96ST3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIN3AQ96ST3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms