Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A9Q96Q91 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A9Q96Q91 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A9Q96Q91 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A9Q96Q91 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A9Q96Q91 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A9Q96Q91 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A9Q96Q91 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A9Q96Q91 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC4A9Q96Q91 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A9Q96Q91 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A9Q96Q91 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms