Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP4Q96PP9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.3 ms