Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP3Q96P20 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP3Q96P20 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms