Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
ZNF488Q96MN9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms