Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms