Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUSD3Q96L08 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms