Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJD4Q96KN9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJD4Q96KN9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms