Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTV1Q96GA3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LTV1Q96GA3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms