Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX11Q96FC9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX11Q96FC9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX11Q96FC9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX11Q96FC9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms