Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C18orf8Q96DM3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms