Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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RNF183Q96D59 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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RNF183Q96D59 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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RNF183Q96D59 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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RNF183Q96D59 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RNF183Q96D59 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF183Q96D59 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RNF183Q96D59 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RNF183Q96D59 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF183Q96D59 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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