Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAF2Q96CS3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms