Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP13Q92995 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP13Q92995 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP13Q92995 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP13Q92995 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP13Q92995 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP13Q92995 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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