Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA3Q8TBC4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA3Q8TBC4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms