Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms