Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38AQ8NAV1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38AQ8NAV1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms